在日本某个特殊的时刻，文学书籍突然被不明力量染成漆黑，这一异变的根源来自书中负面情绪孕育的“侵蚀者”。被侵蚀的文学作品会逐渐从人类的记忆中消退，最终仿佛从未存在于世间。为了应对这场文化危机，拥有特殊能力的“炼金术师”以特务司书的身份被派往图书馆，他们与转世的文豪们结成同盟，共同抵御破坏书中世界的侵蚀者。在这场守护文学的战斗中，《文豪与炼金术师》未删减的完整故事展现了跨越时空的信念对决，通过文豪们被召唤的灵魂与炼金术师并肩作战的历程，传递出对文学遗产永不磨灭的珍视。